在咸丰早年，咸丰帝对奕诉十分亲密，异常重用。咸丰三年(1853)九月，太平军北伐部队直逼京师，咸丰帝即派奕诉办理巡防事宜，署正白旗领侍卫内大臣，十月，出任军机大臣，当时奕诉还不满二十二岁。咸丰四年(1854)二月，任蒙古都统。四月，授宗人府右宗正，九月，升宗人府宗令。咸丰五年(1855)正月，总理行营事务。奕诉生母康慈皇太贵妃病重，奕诉屡次要求咸丰帝尊其母为太后，咸丰帝默而不答。一次咸丰帝到康慈皇太贵妃卧室看望，康慈误以为是奕诉就对他说： “你为什么还在这儿?我所有都给了你。他(指咸丰帝)性情不易了解，不要生嫌疑呵。”从此咸丰帝与奕诉始有猜疑。又一天，咸丰帝又来探望，正遇上弈诉从里边出来，咸丰帝问： “病如何?”奕诉跪泣，说“已病危，意待封号再暝目”。咸丰帝不置可否地“哦，哦”了两声。奕诉见他并未明确反对，径至军机处传旨，令具册礼，所司以礼请，咸丰帝不便反对，即依而为康慈上尊号。七月初一日传旨“尊康慈皇太妃为康慈皇太后”。七月初九日，康慈病死。享年四十四岁。称“孝静康慈弼天抚圣皇后”,不加宣宗成皇帝的“成”字，以区别于其他皇后，创清代历史上皇后不系皇帝谥号的特列。二十一日，咸丰帝即将满腔怒火发泄，颁发严诏： “恭亲王奕诉于一切礼仪多有疏略之处，着勿庸在军机大臣上行走，宗人府宗令、正旗满洲都统均着开缺；并勿庸恭理丧仪事务、管理三库事务。仍在内廷行走，上书房读书，管理中正殿等处事务。必自知敬慎，勿再犯类似过错，以负朕成全之至意。”咸丰帝与奕诉的关系从而坏到了极点。尽管咸丰七年(1857)五月复授蒙古都统，咸丰九年(1859)四月授内大臣，但兄弟之间的感情裂痕是难以弥补的。奕诉由不满咸丰帝延伸为不满咸丰帝的左右亲信，这正是祺祥政变的重要远因之一。